O Centro de Ensino e Pesquisa – CENEPE, iniciou suas atividades em 2004 vinculada diretamente à Direção Técnica. Seu principal objetivo é promover e estimular o estudo e a pesquisa no Hospital Bruno Born. A grandiosidade de dados, perfis, imagens e técnicas agregadas no trabalho de assistência aos pacientes, serve como referencial importante para novas estratégias de melhoria da própria assistência dentro da instituição.